浮游动物多样性的评估需综合多维度指标和方法。物种组成与丰度是基础，通过显微镜观察或成像技术（如FlowCam）鉴定并计数样本中的物种，计算密度和生物量。分子生物学技术（如高通量测序）可弥补传统形态学鉴定的不足，尤其适用于微小或隐存种。多样性指数（如Shannon-Wiener指数、Simpson指数）量化群落的物种丰富度和均匀度，而功能多样性分析（如摄食类型、体型谱）揭示生态功能差异。 时空尺度至关重要，需在不同季节、水深和区域采样以捕捉动态变化。环境参数（温度、盐度、营养盐）的同步监测有助于解析多样性驱动因素。人为影响（如富营养化、渔业活动）可通过对比干扰与自然区域的群落差异来评估。此外，长期监测结合稳定同位素或脂肪酸标记法，能追踪食物网结构变化。 现代技术如自动化成像系统和生态模型（如物种分布模型）提升了评估效率。例如，将传统分类与eDNA技术结合，可更全面表征多样性。最终，评估结果需服务于生态保护，如识别关键种或脆弱区域，为海洋管理提供科学依据。
